- 第1章 皮卡丘，骨灰级御兽
- 第2章 战胜强敌
- 第3章 羁绊的力量
- 第4章 御兽反派鼻祖
- 第5章 十万伏特天克
- 第6章 御个虫子
- 第7章 收服比比鸟
- 第8章 虫子进化
- 第9章 火箭队败象显露
- 第10章 武士少年的挑战
- 第11章 群殴
- 第12章 铁甲蛹的危机：蜂群之怒的逆袭
- 第13章 巴大蝴完胜对手
- 第14章 尼比市
- 第15章 小智与皮卡丘的极限特训
- 第16章 御兽之巅——三巨头组团
- 第17章 救救皮皮
- 第18章 皮皮进化
- 第19章 神奇的力量
- 第20章 华蓝市的水中花
- 第21章 城市鏖战
- 第22章 第二枚勋章到手
- 第23章 场不败的小明
- 第24章 搞笑三人组
- 第25章 被霸陵的少年
- 第26章 以战会友
- 第27章 神奇宝贝乡的妙蛙种子
- 第28章 营救小火龙
- 第29章 杰尼龟军团登场
- 第30章 挑战龟王
- 第31章 正辉的灯塔
- 第32章 战胜雷丘
- 第33章 打不死的火箭队
- 第34章 神奇宝贝漂流记
- 第35章 与宝贝们重逢
- 第36章 蓝普尔其的假日
- 第37章 银婆婆的觉悟
- 第38章 超度亡灵
- 第39章 巴大蝴的恋曲与别离
- 第40章 少女的青睐
- 第41章 雾隐之塔与幽灵的邂逅
- 第42章 幽灵之舞，对抗超能力
- 第43章 怒火中烧，火爆猴的试炼
- 第44章 收复臭臭花
- 第45章 迷雾之城，索利柏的催眠之夜
- 第46章 格斗神奇宝贝大战斗
- 第47章 小磁怪的电气老鼠之梦
- 第48章 地脉觉醒：地鼠之潮与奇迹之光
- 第49章 浅红道馆的忍者决斗
- 第50章 火焰的神奇宝贝大赛跑