弘光政权时期：
政权建立
- 背景：1644年，李自成军攻占北京，崇祯皇帝殉国，明朝在北方的统治崩溃。而南京作为明朝的陪都，保留着一整套中央机构，具备建立政权的基础。
- 建立：同年五月初三，明南京兵部尚书史可法、凤阳总督马士英等在南京拥立福王朱由崧，先称监国，五月十五日即皇帝位，年号弘光。
政治方面
- 权力争夺：东林党人与马士英等军阀围绕帝位展开激烈斗争，最终马士英等因拥立有功把持朝政，排斥史可法等忠臣，内部倾轧严重，政治腐败，卖官鬻爵之风盛行。
- 决策失误：弘光政权采取“联虏平寇”政策，试图联合清军剿灭大顺军，以黄河为界划定国界，结果被清廷拒绝，丧失了战略主动权。
军事方面
- 军队构成：主要由江北四镇（刘泽清、刘良佐、高杰、黄得功）的军队以及武昌左良玉部等组成，兵力众多，但军队腐朽，将领们拥兵自重，互相争权夺利，怯于公战，勇于私斗。
- 军事失败：1645年正月，清军攻破潼关后转兵南下，南明前线军队一触即溃。三月，左良玉以“清君侧”之名顺长江东下，马士英急调江北四镇迎击，致使江淮防线空虚，清军乘机南下，迅速攻破徐州、渡淮河，兵临扬州城下。
经济方面
- 财政困境：弘光政权虽坐拥江南富庶之地，但由于统治集团的腐朽，豢养大量军队，财政入不敷出，不仅没有减轻百姓负担，还变相加征赋税，导致民怨沸腾。
- 赋税政策：继承了崇祯朝竭泽而渔的赋税政策，如甲申十二月决定对民间田土加征赋税，地方官胥也趁机横征暴敛，剥削百姓。
文化方面
- 文学创作：这一时期的文学作品多反映社会动荡和人民疾苦，如戏曲作家李玉的《清忠谱》，展现了明末东林党人和阉党之间的斗争以及苏州人民的反抗精神。
- 学术思想：一些学者开始对明朝灭亡的原因进行反思，如黄宗羲在《明夷待访录》中批判了封建君主专制制度，提出了一系列革新思想，对后世产生了深远影响。
弘光政权结束
军事失利
1645年，清军在多铎的率领下迅速南下。南明江北四镇中的刘泽清、刘良佐不战而降，高杰此前已被刺身亡，其军队混乱。只有黄得功部进行了抵抗，但难以抵挡清军攻势。清军顺利渡过淮河，兵临扬州城下。史可法坚守扬州，但城破后清军进行了残酷的“扬州十日”大屠杀。之后清军继续东进，直逼南京。
政权崩溃
面对清军的兵临城下，弘光政权内部一片混乱。马士英等大臣弃城而逃，弘光帝朱由崧也仓皇出逃。1645年五月，清军不费吹灰之力占领南京。弘光帝逃至芜湖后被黄得功部将田雄等人擒获，献给清军，后被押往北京。
最终结局
1646年，弘光帝朱由崧在菜市口被斩首，标志着弘光政权的彻底结束。弘光政权的灭亡使南明在江南的统治核心瓦解，此后南明其他政权虽继续抗清，但弘光政权的覆灭无疑是南明走向衰落的重要转折点，抗清形势更加严峻。
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隆武政权：
政权建立
- 背景：1645年五月，弘光政权灭亡，明朝宗室及大臣继续在南方抵抗清朝。闰六月七日，明福建巡抚张肯堂、礼部尚书黄道周、南安伯郑芝龙等拥明唐王朱聿键监国于福州，二十七日朱聿键即皇帝位，改福州为福京天兴府，次年为隆武元年，隆武政权建立。
- 皇帝：朱聿键是明太祖朱元璋九世孙，端王朱硕熿之孙，他继承了唐王之位后，曾因违反明朝律令擅自离开南阳而获罪入狱，后被弘光帝赦免。
政治举措
- 整顿吏治：隆武帝试图结束党争，整饬吏治，对贪污腐败等行为进行打击，以图建立廉洁高效的政府。
- 加强中央集权：他定南方各镇抚司，重掌乌斯藏都司，努力消灭地方割据，加强对地方的控制，提升南明的整体实力。
军事策略与行动
- 战略方针：吸取弘光政权“联虏剿寇”失败的教训，确立了“联寇抗清”的战略，试图联合农民军余部共同对抗清军。
- 北伐行动：隆武帝计划以15万兵力进行防守，10万兵力出击进攻清军，但因郑芝龙怀有二心，拒绝发兵和供应粮饷，北伐受阻。此外，黄道周不顾势单力薄，率师北伐，终因寡不敌众，在婺源被俘，后被清廷杀害。
经济状况
- 财政收入：主要依赖于郑氏家族的对外贸易收入，但仍难以满足庞大的军费开支。
- 赋税政策：为弥补财政缺口，继续征收“辽饷”“正饷”“助饷”等，甚至提前征税，名曰“预征”，给百姓带来了沉重负担。
文化方面
- 文化交流：隆武帝积极联络各方，包括派人到澳门请求葡萄牙的军事支援，这在一定程度上促进了中西方文化的交流与接触。
- 思想激励：隆武帝本人志在复兴明朝，其行为和决策对当时的社会思想产生了一定的激励作用，激发了部分民众的抗清热情和民族意识。
政权灭亡
1646年七月，清军攻下浙东浙南后立即挥师南下，郑鸿逵放弃仙霞关逃回浦城，郑芝龙暗中与清军接洽投降，撤兵到安平镇，福建门户敞开，清军长驱直入，隆武帝出奔汀州，八月二十八日被清军追获擒杀，隆武政权灭亡。
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绍武政权：
政权建立
- 背景：1646年，隆武帝朱聿键被俘殉国，其弟朱聿鐭逃至广州。而此时，其他南明势力在广东肇庆推举桂王朱由榔为监国，后朱由榔逃往广西梧州，广东出现权力真空。
- 建立：同年十一月初二，南明大学士苏观生、隆武辅臣何吾驺等拥戴朱聿鐭监国于广州，初五，朱聿鐭匆忙称帝，改元绍武。
政治状况
- 内部权力争斗：政权由苏观生把持，为争帝统，与永历政权互不相让，引发内战，严重消耗南明内部力量。
- 官员选拔混乱：为拉拢人心，仓促间大肆封官，“除官数千”，但官员素质良莠不齐，且多为苏观生亲信，导致政治腐败，统治基础薄弱。
军事情况
- 军事力量构成：主要兵力除广东总兵林察所部外，还招抚了郑、石、马、徐四姓海盗为官军，军队成分复杂，纪律性差。
- 军事行动：与永历政权兵戎相见，在三水县等地展开内战，虽取得了一些胜利，但也削弱了自身抗清力量，面对清军进攻时，难以形成有效抵抗。
经济形势
- 财政困境：绍武政权统治区域主要限于广州及周边地区，财政收入有限。同时，为维持政权运转和军队开支，不得不加重百姓负担，导致民怨沸腾，社会矛盾激化。
- 经济破坏：战争和动荡对当地经济造成了严重破坏，商业停滞，农业生产受到影响，经济陷入困境，无法为政权提供坚实的物质基础。
文化方面
- 文化活动受限：由于政权存在时间短暂，且处于战争动荡之中，文化活动受到极大限制，没有形成有影响力的文化成果。
- 文人志士的抗争：尽管如此，仍有一些文人志士坚守气节，以诗文表达对国家命运的担忧和对清政权的抵抗情绪，展现了不屈的民族精神。
政权覆灭
1646年十二月十四日，清军以十四骑伪称援兵赚开城门，大队蜂拥而入。苏观生急召宿卫百余人抵敌，次日，广州落入清军之手，朱聿鐭及苏观生等皆自缢而终，绍武政权仅维持四十一天就宣告覆灭。
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永历政权：
政权建立
1646年，隆武帝朱聿键被害后，明两广总督丁魁楚、广西巡抚瞿式耜等拥戴桂王朱由榔于肇庆称帝，以次年为永历元年。
发展历程
- 初期困境：政权建立初期，面临清军的强大压力，朱由榔多次逃亡，1647年正月，李成栋部占领梧州，丁魁楚投降被杀，永历朝廷处境艰难。
- 第一次抗清高潮：李自成余部与明军联合，1648年，各地抗清力量纷纷响应，收复了湖广、桂部分地区，大明名义控制区域扩大到七省，还包括北方三省一部以及东南沿海岛屿。
- 大西军联明抗清：1652年，永历政权接受张献忠部将孙可望、李定国联合抗清建议，以大西军余部为主体的明军展开全面反击，李定国取得靖州大捷、桂林大捷、衡州大捷等，刘文秀出击四川也取得胜利，同时东南沿海的抗清军队也发动攻势，出现了南明时期第二次抗清斗争高潮。
- 内部纷争与衰败：孙可望妒忌李定国战功，逼走李定国，后孙可望谋篡位，引发内讧，兵败后降清，西南军事情报尽供清廷。1658年，清军三路进攻贵州，次年吴三桂攻入云南，永历帝逃往缅甸。
政治情况
- 权力争夺激烈：内部党派林立，文臣武将之间争权夺利，互相攻讦，严重削弱了政权的凝聚力和战斗力。
- 决策失误频繁：在战略决策上，未能制定出有效的抗清策略，且多次在关键时刻做出错误决策，如放弃广东等地，导致局势恶化。
军事方面
- 军队构成复杂：主要由明朝残余军队、大顺军余部、大西军余部等组成，成分复杂，指挥不统一。
- 将领矛盾重重：将领之间存在着严重的矛盾和利益冲突，如孙可望与李定国之间的矛盾，导致大西军内部分裂，抗清力量遭到极大削弱。
经济状况
- 财政收入匮乏：控制区域有限，且多为战乱地区，经济遭到严重破坏，财政收入难以保障，无法满足军队和政府的开支需求。
- 货币制度混乱：为解决财政问题，大量铸造钱币，如“永历通宝”等，但铸造工艺粗糙，质量参差不齐，导致货币贬值，市场混乱。
咒水之难：顺治十八年（1661年），缅甸国王莽白在清王朝的威逼利诱下，发动“咒水之难”，永历帝随行官员及士兵三百余人被杀，永历帝本人失去人身自由。
永历帝被俘：1661年十二月，缅甸国王将永历帝交于清军，吴三桂率清军入缅索获朱由榔，班师昆明。
永历帝被杀：1662年，吴三桂下令用弓弦勒死了永历帝及其子，南明永历政权彻底覆灭。
永历政权的结束标志着明朝在大陆上的最后抵抗失败，加速了清朝统一全国的进程。同时，使得大量南明遗臣和士人失去依靠，对当时的社会稳定与发展产生了影响。
此外，还有一些存在时间较短或影响力较小的政权，如潞王监国政权、靖江王监国政权、益阳王监国政权等。