蓝普鲁市是一座度假城市，靠着沙滩与大海，每年都吸引着大量的旅客。旅客来到沙滩后会产生一种名为“泳装美女”的特产，又为这座城市增色不少。
沙滩上各色各样的帅哥美女，本来是一副唯美的画面，但一个少年的出现破坏了这幅画面，众人都看着那个少年不由的咽了下口水。
“再来二十份炒面”小智和他的六只神奇宝贝正在大吃特吃，而他后面的盘子已经堆的和山一样高了。而旁边的小霞和小刚一副我不认识的表情。
一上来小智就到这里大吃特吃。“吃的好饱啊”小智和它的神奇宝贝都躺在地上说道。
“小智你这是从哪个贫民窟里逃出来的，吃相那么难看，还穿者破掉的衣服，看起来真可怜”小茂和他的女朋友们登场了（小茂虽然脚踏实地的旅行，但是还是有很多女生跟着）。
“这不是我的手下败将吗”小智立马跳起来和小茂对上了。
“你们两位一见面就这样子，两位都是我真新镇的未来啊”大木博士马上出来劝架。
“小智，你上次说要找的女朋友在哪呢”花子出来看热闹。
“看在大木博士（花子阿姨）的面子上饶了你”小智和小茂同时说到。
“对了妈妈，大木博士，这是小霞，这是小刚他们现在和我一起旅行，而且小霞是我的女朋友（明面上不承认，但是都把对方当成了男女朋友）”小智向他们介绍到。
“小智这一路幸苦你们了”
“哪里，是我们麻烦他了”×2
“小智，听我爷爷说，你那五员老将都没带，一直在培养新的神奇宝贝，看起来培养的不错，很有精神吗”
“我不能一直吃老本，也要有新的精灵才行，防止出现问题”小智挥了挥手道，皮卡丘带着其他五只给大木博士他们打招呼。
“还有妈妈和大木博士，你们来这里干嘛”小智明知故问道。
“小智，上次忘了跟你说，有个女孩特地来找你喔~过来吧”花子向旁边的一个女孩招了招手。
一个穿着红色的可爱系泳装的女孩慢慢走了过来，一对胸脯高高鼓起，和那纤细平坦的腹部形成鲜明对比，她一直不敢抬头看小智，白皙的脸蛋泛着红晕，小声地说到“小智，你还记得我吗”。
小智走了过去，左看看右看看，最后有点激动的说“你是谁啊”
“小智你忘了以前的誓言吗”想到这女孩越来越伤心，她看了看小智，又看了看小智边上的小霞，开始哭泣起来。
“没想到我儿子是个抛妻弃子的坏蛋”花子伤心的说到。
小智拍了自己的额头一下不快点解开这件事，恐怕以后都没有好果子吃。小智走过去用手轻轻擦去女孩的眼泪说道“瑟蕾娜我不是说过了吗，永远不要哭，哭了就不漂亮了，刚才是逗你的”
瑟蕾娜听到小智叫她的名字“原来小智还记得我”一把就抱住了小智。小智轻轻抚摸着瑟蕾娜的头发。
过了一会儿，瑟蕾娜终于发现大家的目光都看着自己，马上把小智推开。想想刚刚的事情“小智你就是喜欢欺负我”
“你又没告诉我你要来，而且咲儿阿姨同意你来关东吗”小智一脸笑嘻嘻的表情。
当初一直恳求妈妈让她来，瑟蕾娜为了能来关东，使出一哭二闹，就差三上吊了。最后咲儿阿姨实在没办法了，只能答应瑟蕾娜了，在领取了新人训练家使用的神奇宝贝后，瑟蕾娜就来到关东花子阿姨这里，而咲儿很无奈的得出了一个结论“女大不中留”，这些瑟蕾娜是不会说出来啦。
“我来履行以前的承诺，你不会不答应吧”一副你不答应我哭给你看的样子
“当然没有啦，那么瑟蕾娜，欢迎和我们一起旅行吧”小智发出邀请之手。然后向小霞和小刚他们介绍“小霞，小刚这是我以前的玩伴瑟蕾娜，瑟蕾娜这是我现在的旅行伙伴”
“只是玩伴吗”瑟蕾娜心里想到，然后和小霞他们打招呼。
“初次见面，请多多关照”×3
“小智既然衣服破了，那就穿这套吧”花子拿出来一套新衣服给小智。
小智马上跑到更衣室穿上了（第一部的那套，以前穿的都不是几部里的一套）
“那我们走吧小霞，小刚，瑟蕾娜，对了大木博士待会给我一个超重球”小智拉着瑟蕾娜的手就走。瑟蕾娜被小智这感动的说不出话来了跟着就走了，小霞两人也马上追了过去。
“小智走的真急，我还没问他要超重球干嘛呢，花子你不阻拦一下吗”大木博士对花子说。
“男人总要闯出一份天地来的”看着渐渐远去的小智花子说道。
“好无聊啊”小智伸了一个懒腰，无精打采的说到。
“这也是没有办法的，我们刚好错过了上次航班，只能再等三个小时。谁让你吃那么多的”小霞看着瑟蕾娜的爱宠焰耳狐说到。
“如果这时候有点热闹该有多好啊”小智这话刚说完，远处的一艘船发出一声巨响，然后就沉没了，小智知道那只巨大水母就要到了。
“这可不关我事啊”小智解释到。这时，一只墨海马浮了上来，不停的向小智比划。
“小智你翻译一下看看他到底在说什么”看着墨海马吐出的信息后小刚说道。
“好像是毒刺水母要向人类展开报复”小智解释到。
“可是现在应该以疗伤为主吧”小霞看到墨海马这么重的伤心痛的说道。
“去吧神奇宝贝球”小霞立刻丢出了宝贝球，收服了墨海马，然后把墨海马递给小刚疗伤。
不一会儿，一个老太婆过来用一百万来招募训练家，帮她赶走玛瑙水母群。
“真是让人讨厌”对于爱好水系神奇宝贝的小霞来说，这些都是一群讨厌的训练家。
“不用管他们，我们待会也去反正有钱”小智推着他们先离开了，他现在虽然有实力对付那一个巨大毒刺水母，但是得先找个安全的地方。然后去对付玛瑙水母们，但看到的是一只巨大的毒刺水母，有小智快龙那么大
“这真的是毒刺水母吗，大的有点让人无法接受啊”对任何人来说都有点够呛，小智除外。
“难道毒刺水母要破坏这座城市。不行我要去阻止它”说完后小霞立马冲了出去。
“小霞，待会我去和它战斗等他倒下后你就收服他，这是超重球你拿好”小智拦住小霞后把超重球给她，然后对她说道。
“大家出来吧”小智的所有神奇宝贝都出来了，小智命令它们马上对付这些玛瑙水母并开出一条路来，直通到毒刺水母吗
“皮卡丘不用留手，使用十万伏特结束这场战斗”小智打赢了毒刺水母并且小霞也收服到了。
至于那个老太婆没实力还装逼，被毒刺水母抽飞了，事情可以说顺利解决了，并且也拿到了奖励所以就离开了。
毒刺水母被小智传送给大木博士了，打算让大木博士帮忙养着，主要是华蓝道馆养不起。