待火势扑灭时，山贼早已逃得无影无踪。
刘石让人将朱家嫡系全部控制，除部份随入堡山贼逃走外，大部被抓。再选派精明兵卒四处巡查，竟然发现几处地窖，每一处地窖都藏有金银及五铢钱，还有粮食，数量还不少，刘石让人守着，待战事结束后在一一清理。
刘石上城墙时，外面的战事早已结束，几百名骑士，正在堡外来回奔驰，一堆堆的山贼被圈在几处，地上倒了不少人。
刘石令人将堡门打出，将山贼收录一处，再将散落在各处的刀、枪、戟等武器也收集起来。
这些山贼恐怕做梦也没有见过几百个骑兵在平地上是如何的恐怖。两千人除了少部份逃脱，大部被捉，就连刚从堡里面逃出的贼寇也没来得及逃脱。
此次朱家堡歼灭战，共击杀山贼四百多人，大部被骑兵所杀，俘虏山贼一千六百多人，朱家嫡系三十六人，从者九十人。缴获粮食五千斛，金八百多斤，银一千多斤，五铢钱一百多万，各类布匹无数，田地三万五千亩，牛三百头，鸡、猪、羊无数。
通过审迅，刘石知道朱家在商雒县其他地方还堆置粮食过万斛。刘石迅速让曹性、史涣派人前去收取，看着眼前的这么多钱，叹道：“这才叫称得上豪强。”
第二天，刘石带着庞大的车队回到县城时，惊动了无数人。数百骑兵斩杀山贼的场面已深深地印入了县兵、乡民及山贼心中。护武关道营兵也是一战成名。山贼或朱家嫡系、从者，除罪大恶极者，顽固不化者处死外，辨别之后依然是挑出一部份人征为营兵，其他全部被编入屯田之用。
朱家堡刘石没有放弃，而是作为一个堡垒存在，派驻县兵一百，组织朱家堡乡民闲时训练抗击山贼。
通过这一战，刘石派往全县各乡的游檄已被接受，并认真地按县府的要求组织乡民训练。通过这一战，原上雒县的税赋也同意上缴了。刘石只收了两年，共近两百万钱，两万多斛粮食，刘石要求大部份用粟米代替。
这样一来，刘石的养兵及县府开支的费用才算是基本解决。
解决钱财费用这些后顾之忧后，刘石招集典韦、曹性、高顺、史涣、刘真等商议如何尽早地征剿山匪，完成天子交给的任务。
典韦说“由他带人去将黄皮部攻下来。”
高顺道：“还是应采用招抚与征剿两手进行，如今大汉朝已经是杀人太多了，许多山贼也是迫不得已才入山为寇的。”
刘真也同意高顺的意见，说：“这商雒到合并后，地域广大，比涿县大得多，才三万多人，加上我们带来的，也刚过四万，实在是太少了。应将山贼全部劝下山，开垦土地，只有土地开垦了，才能养得起这几千军士。不然这些钱财、粮食不够两年就会花光，可不能到时再去打一个豪强。也样也会引起朝庭的非议的。
除非将军士散去，可这商雒县，林大沟深，又与南阳、颖川相接。那地方可是黄巾军的老巢，他们随时都会窜过来，到时又该如何？”
刘石道：“好！招抚山贼的事就由刘真、高顺、史涣三人负责。不听招抚的，坚决进行征剿，这方面的情报，史涣要早日摸清楚。我们现在有营兵和县兵近两千人了。再加上临时征招的乡勇，我相信随时能组织五千人的军队。因此，绝不能让山贼在武关道上再盘据一年，必须在本年内清剿完成。”
两天后有人来县城报告，山贼失败后在返回途中，将一个叫南山亭的村堡强行攻破，将堡中之人全部屠尽。
刘石听到消息大怒，亲自带人去该亭查看，只见该堡依山势而建，本是极险之地。不过山贼在盛怒之下，不计代价强攻，终因堡小人少，不敌山贼，被攻破。
刘石发誓一定要尽早消灭山贼，还商雒县人一个清静。回到县城后，刘石找人将刘真、典韦、高顺、史涣等招开商议，要尽快启动对蓝田贼寇的招抚，不服从者坚决打击。这个任务由高顺、史涣完成。
典韦带兵进驻朱家堡，配合曹性监控黄皮部，防止山贼狗急跳墙，再次残杀乡民，抢劫财物。待蓝田山贼招抚结束后，立即对黄皮部、彭脱部展开征剿。
会议过后，商雒县各处传出消息：护武关道都尉部及商雒县府对在武关道上及商雒县境内的山贼给予两个选择：一是下山从良，可获得商雒县府提供田地，只需按朝庭律令交纳租赋，对有技艺者可来县城居住，从事技艺生产。
二是对拒不从良者，护武关道营兵将在商雒县兵的配合下对山寨进行围剿，顽抗者就地击杀。
随后又有传出：凡被俘山贼愿意回山寨劝说其他山贼从良者，只需与所在地的官长请示，就可返回山寨。劝说有功者，可获得田地、金银等赏赐。
许多人都担心放走之后这个山贼会一去不回，刘石笑道：“放他们走，就是要让他们回去之后告诉其他山贼：是从良，还是继续从贼。从良者有田种、有饭吃，从贼等着围剿。”
众人半信半疑，不久传来消息说：蓝田五股山贼有三股愿意下山从良，一股拒不从良，还将到寨游说的人斩首。
另一股因一月前劫杀过刘石，担心刘石报复不敢下山。
原来，被俘山贼回到山寨之后，将刘石的意思同寨中其他头目讲了一遍，又将朱氏豪强勾结山贼被刘石所灭的事向山寨头目讲了一遍。山寨众头目本来还担心官府有假，是骗他们下山的。听到朱府被灭又是将信将疑，找来其他山寨头目商议。
其实现在这山寨中人的日子也不好过，自他们占领武关道后，商旅稀少，本地的大户又都是拥有众多家丁家将。以他们的实力根本上讨不到好，只能抢些小富户。
但蓝田这几年打仗，军队多，他们也害怕抢多了，引来官府前来征剿。
以前的上雒县有黄皮部，也不是他们能去的地方。
虽说是山贼，也只能在山中开点荒，种点地，生活过得朝不保夕。听到放回山贼说，只要努力开荒种地，就有饭吃，还能管饱，另三个山寨的头目有点意动。这才派人下山与刘石联系，请求招安。
刘石当即应承他们可到程家贩设堡居住，开荒垦田，新开垦之田，一年内不收赋税，第二年收取五十抽一，第三年则按大汉律法三十抽一。但口赋、算赋及徭役、兵役必须安律完成。
刚下山无粮者可向县府租借，可分期偿还，也可用工代还。这些山贼本来还担心刘石在骗他们，见刘石说得这样细致，也就信了。三个山寨总计二千人，被安排在离程家贩十里，沿丹水河岸的一块平地上。
对于曾经打劫过他的那股山贼，刘石也传信应承只要愿意下山从良，服从县府管理，不在追究。
原本犹豫不决的山贼最终也同其他三股一样下山从良了。刘石仍将这股山贼安排在沿武关道丹水岸边居住，离前三股山贼居住地约四十里地，同样允许设堡。
不过，山贼落定之后，刘石以服役为名从中抽调年轻少年二百人到县城服从训练，并派出县兵担任三老、啬夫、游檄，进行教化、赋税、治安管理，对无粮之家派出粮食进行救济。如此一来，这些人才是真正安心了。