攻打下爪哇岛、苏门答腊岛，基本就等于统一了东印度群岛。
郑明用终于实现了自己的诺言：“平南洋，”用实际行动证明自己不是袁崇焕一样的人，只会夸夸其谈。
虽然郑明下手狠了一点，屠戮了岛上大部分的暴徒，甚至有灭族的举动，但是依然得到朱由检的赏识。
“大国天威不可冒犯，本来就想灭了你们，你们倒好，自己送上门来了，这省去了大明不少的功夫。”想到这里，朱由检不由得佩服起郑明：
“你小子有两把刷子呀，可堪重用！”
“来人呀，着人加封郑明为南国公，建立南洋都指挥史司，以郑明为南洋都指挥史。节制南洋各岛，专门经略南洋，进一步开发收服东印度群岛。”
要知道这东印度群岛有上万个岛，很多岛上还有各种土着人 ，这些岛以后就都归郑明管理了。
郑明一举封为南国公，当上南洋都指挥使，令毛云鹏羡慕的不要不要的。
同样都是将门之后，这一下子，毛云鹏就被郑明甩开十万八千里，这个差距可就太大了，毛云鹏有点接受不了。
要说出道，毛云鹏可比郑明。早了好几年，论资历也比郑明高，如今郑明。当了国公不说，还当上了指挥使，节制毛云鹏。你说这毛云鹏能不郁闷吗？
不过这也不赖别人，当初朱由检可是钦点你毛云鹏经略东印度群岛的，是你自己不要去的。
不过毛云鹏还是有机会的，南洋诸岛都被大明王朝拿下了，连成一片，但是马来半岛依然有荷兰人盘踞，半岛背面还有法国人盘踞，只要毛云鹏够努力，机会还是有的。
毛云鹏不甘心只做一个纳土纳男爵，开始奋发图强、厉兵秣马，准备攻取马来半岛。
同年年底，马来半岛出现暴乱，毛云鹏以当地的荷兰人排华屠杀华人为理由，派兵强行登陆，攻击马六甲城。经过一番恶战，打跑了最后一批荷兰殖民者。顺利的占领了马来半岛。
原来这毛云鹏这些年在马来半岛安插了大量的卧底，此外朱由检又赏给了毛云鹏一百多支马克沁机枪，才成功的助毛云鹏入主马来半岛。
这马来半岛宛如一颗璀璨的明珠，镶嵌在南洋的中心，其战略位置极其重要，牢牢控制着马六甲海峡。这马六甲海峡，乃是连接印度洋与太平洋的咽喉要道，无数商船、战舰往来穿梭，掌控此处，便掌控了世界贸易与海洋霸权的关键。
拿下马来半岛，毛云鹏也凭此功绩被朱由检封为马来伯，任马来总兵。
从此，南洋这万里海疆尽归大明王朝所有。岛上各个族群，无论是华人、马来人还是其他民族，都亲眼目睹了大明王朝的强大与威严。他们纷纷心悦诚服地奉朱由检为万民之主，万王之王。
在大明的统治下，南洋地区迎来了前所未有的和平与繁荣。商船往来频繁，贸易蒸蒸日上，不同文化在这里相互交融。各地建起了学校，传播着儒家文化；港口城市日益繁华，成为了世界贸易的重要枢纽。
拿下南洋以后，大明王朝东洋海军在太平洋一带再无敌手，但是面对茫茫的太平洋，仅仅依靠大明王朝的东洋海军是不够的。
朱由检打算重新改组东洋海军，建立新的大明王朝海军。
新的海军将命名为：大明王朝海军太平洋联合舰队，太平洋联合舰队下面分为东洋舰队和南洋舰队。
东洋舰队管理长江以北，经东瀛群岛，一直到阿拉斯加的海域。
南洋舰队以长江为界，管理长江以南一直到明洲（澳洲）的海域。
太平洋联合舰队的总司令依然由定海伯黄龙担任，东洋舰队司令由东平伯刘香担任。南洋舰队司令由李定国担任。
不过此时的太平洋联合舰队总共才三十一艘铁甲战舰，有点略显薄弱。而且这些战舰还担负着远洋渔业捕捞的任务，一年到头是忙个不停。
如今划分成两支舰队，船只明显不够用了。如果一支舰队只有十五艘战舰，怎么能够满足海军的需要？
幸好朱由检早有准备，精心策划，多方奔走，终于从美利坚国拿到了生产海警船的批文。
洛杉矶造船厂的第一批海警船设计满载排水量为7000吨，全面搭载125毫米54倍径火炮。而且船上还安装有远洋通讯电台。
朱由检以几个小国的名义，用虚假订单的形式，自己订购了三十艘海警船。这种海警船，虽然不是驱逐舰，如果拿到大明王朝用上个一百多年还是没有问题的。这些海警船虽然在定位上并非纯粹的驱逐舰，但其坚固的船体、先进的装备，引入大明王朝后，若能妥善维护，用上一百多年也不在话下。
随着这三十艘海警船的加入，大明王朝太平洋联合舰队的实力得到了显着提升，战舰总数达到了六十一艘。东洋舰队分得三十艘战舰，南洋舰队分得三十一艘战舰，这些战舰完全能够满足海军执行任务的需要。
何况太平洋联合舰队此时依然保留着一百多艘的木制战舰。这些船虽然不及铁甲战舰，但在近海防御、辅助巡逻等任务中，仍能发挥重要作用。
与此同时，朱由检大力推动大明王朝造船业的发展。福建船政局在他的支持下，从现代世界购置了大量先进的机器设备，还接收了一批在洛杉矶船厂培训过的技术工人。
这些工人带回了先进的造船理念与工艺，使得福建船政局得以迅速建立起自己的铁甲舰造船厂。如今，该厂正在紧锣密鼓地试生产三千吨级的铁甲战舰，一旦实现量产，便如同下饺子一般，源源不断地为太平洋联合舰队输送新鲜血液，助力大明王朝的海军力量迈向新的高峰，在太平洋的万顷碧波上纵横驰骋。