石首城明军物资储备地，此时已经化成一片火海，负责守卫的明军四散而逃，原来马蛟鳞投降清廷后被派来充当佯装支援，章旷不知马蛟鳞已经投降清廷，还亲自因迎接，结果当场被杀，马蛟鳞带的兵不多，可都是博尔辉的精锐，而且外围勒克德浑率军抵达，石首城很快被清军占领。
勒克德浑来不及清点缴获，立刻命令大军水陆并进，直扑忠贞营大营。
李过和高一功也反应过来，立刻布置防御，可他们在荆州久战，早已是疲惫之师，哪里能挡住清军的进攻，再加上荆州城清军看准时机，从城内杀出，忠贞营被两面夹击，陷入混乱，最终无奈四散而逃。
随着忠贞营战败，何腾蛟畏惧不战，南明的反攻以失败告终，而且好不容易聚起的荆襄大军损失惨重，尤其忠贞营遭到重创，再也无力反击清军。
勒克德浑随即乘胜追击，大肆清除南明在荆襄、湖广的势力，兵锋直指福建。
天兴府，也就是福州，行宫之内，朱聿键脸色铁青，目送郑家兄弟离开，如果眼神能杀人，他早就将郑芝龙等人千刀万剐
“真是气煞我也！”
原来何腾蛟惨败的已经传到福建，朱聿键想要郑芝龙发兵支援，结果郑芝龙拒绝出兵，他就退而求其次，让郑芝龙派出一部分兵力去守赣州，赣州隶属于江西，是南明在江西最后一处重镇，而且这里的位置非常重要，它连接福建和广西，如果丢失，清廷大军就能直达福建或者南下广西，隆武政权就彻底没了退路。
但郑芝龙还是拒绝，连一兵一卒都不肯派出，这让朱聿键愤怒无比，可他不敢和郑家闹翻，因为就连自己的行宫都是人家郑家的，更别说福建的士卒了。
“黄尚书，郑家嘴脸暴露无遗，如今清廷马上就攻来了，咱们如何是好？”
黄道周同样怒气填膺，为了隆武政权的稳定他劝朱聿键做了很多让步，可还是低估了郑芝龙的无耻和不顾大局。可他也没有办法，隆武政权的财、军甚至民心都在郑家那边，他也试图拉拢郑家将领，可都以失败告终。
“陛下放心，老臣就是倾家荡产，也会招募一支军队，支援赣州。”
朱聿键看着眼前这位年近六十的老臣，在对比郑家嘴脸，内心一片冰凉。
“大明真的没救了吗？”
黄道周气节非常，和朱聿键要了几份封官圣旨，立刻向西出发，一路募集三千兵力和两月的粮草，进入江西。
然而清军动作很快，勒克德浑命令降将金声桓出兵赣州，同时下令全境的江西降军堵截南明的援兵。
四月，金声桓领军三万攻打赣州，此时赣州守军只有六千人，外围还有一些明军将领，其中有江西官员巡抚刘广胤，江西总督万元吉，兵部尚书郭维经，可他们都是文官，只是名头响亮，能调动的人、钱、粮不多，军队倒是不少，有滇军六千、粤军五千、何腾蛟留下的两千人，还有被招募的江西本地义军四千人，还有路上的黄道周三千人，林林总总加起来也有三四万人，可这些人都是临时拼凑组建的，战斗力堪忧。
好在此时勒克德浑主力还在荆襄湖广一带，另外，清廷内部争功任命宗室贝勒博洛任征南大将军进攻福建、浙江，大军还在路上，给了南明准备时间。
南明军队遇到的都是曾经的“同僚”，属于菜鸡互啄，万元吉还算不错，统一调度，击败了拦截的清军，历经一多个月，终于抵达赣州城下，赣州之围暂时缓解。
不过遗憾的的黄道周所部遇到了大股清军，被埋伏俘虏，押送南京，他宁死不降，最终不屈被杀。
黄道周的死讯传到福州朱聿键悲痛大哭，自己身边唯一的肱骨重臣就这样没了。
六月，博洛大军抵达，金声桓得到了有力支援卷土重来，赣州周围各路明军不敌纷纷被击败，逃的逃，散的散，最终只剩下赣州城一座孤城。
赣州城，郭维经在府邸与四位副将坐在一起，商量守城之策。
“各位，赣州四周各路兵马都被清军击败，目前只剩下我等困守孤城，本尚书身受大明俸禄，决定与城共存亡，但人各有志，我不求各位与我共同赴死，所以，想要离开者概不阻拦！”
水师后营总兵黄志忠抱拳道：“尚书大人，莫要小看我等，如今天下倾覆，我等不愿做清廷鹰犬，何惧一死，愿与大人共赴黄泉。”
其他三人分别是汪起龙、金昌振、徐日彩，这三人只是跟着起身，纷纷表态，死守赣州。
“好，就让我们与清奴决一死战！”
赣州城濒临章江，周长约十四里，高五到七米，厚六米有余，称得上是一座坚城，清军用红夷大炮轰了四天也没有找到破绽，只能架云梯强攻。
守城明军已经报有死志，战斗力直线拉升，他们准备充足，利用守城火炮和各种火器、石头、热水、金汁等打退了清兵一次又一次的进攻。
清军大营，督战的博洛遥望赣州城颇为焦急，自己好不容易说服多尔衮南下捞军功，没想到第一战就碰到了硬骨头，连麾下精锐旗兵都参与攻城，结果还是没有奏功。
“给金声桓传令，分出一部人马，给我四门齐攻！”
赣州城有五座城门，其中一座濒临章江，施展不开，而且城上有火炮，水师战船靠近只是靶子，所以只能攻打另外四门。
赣州城守军只有六千人，分散四门兵力立刻捉襟见肘，伤亡不断增加，战至第十天，已经伤亡过半。
激战至第十一天，终于有人经受不住人心的考验，一队士卒趁着夜里放哨之时用绳子放人去了清军大营，当夜，清军大举进攻，有人里应外合打开城门，守军发觉已晚，但还是拿起武器奋起抵抗，战斗一直持续清晨，最终全部殉难。
清军为了报复将屠刀对准了没有逃离的百姓，赣州彻底沦陷。