佐助受到巨大刺激开启单勾玉写轮眼，后来昏迷。
从此佐助便以“杀死那个男人——鼬”为目标，不断变强。
晋升下忍-佐助与鸣人、樱为木叶隐忍者学校的同期学员。
三人后被分配到精英上忍卡卡西所带领的第七班。他给人一种冷酷，不易接近的感觉，但帅气的外表和忍者学校第一的成绩使得他在学校中拥有众多“迷妹”，因此受到鸣人嫉妒。
在自我介绍时，佐助表示自己讨厌的东西很多，没什么喜欢的东西，而他有一个愿望，就是重振宇智波一族和杀死那个男人。
佐助一开始对队员漠不关心，不搭理鸣人的挑衅，对樱的善意举动也很冷淡。
当第七班开始卡卡西的铃铛测试时，他从一开始就决定独自对付卡卡西，根本没打算要两个队友帮忙，在卡卡西毫不客气地向他指出这一点后，佐助逐渐认识到要成为一个忍者就必须学会团队合作。
当卡卡西宣布鸣人受到的惩罚是不能吃饭后，佐助不顾禁令把自己的便当给受罚的鸣人吃，无意中使三人通过了卡卡西的测试。
波之国任务-第七班在完成一系列的D级任务后，终于接到第一个C级任务：护送桥梁建筑师达兹纳回波之国。
不久后，他们就遭到了鬼兄弟的偷袭。
面对初次实战，鸣人有点儿害怕，失去了抵抗能力，而佐助则冷静应战，直到卡卡西出手救援，心有不甘的鸣人发誓要在后面的战斗里一雪前耻。
后桃地再不斩来袭，卡卡西被水牢术困住，鸣人想出妙计，和佐助配合解开了对卡卡西的束缚。
再不斩被暂时击退后，卡卡西决定通过爬树教三人如何控制查克拉。
鸣人和佐助互相竞争，很快都爬到了树顶，那个时侯两人的羁绊也进一步提升。
战败的再不斩带着白，一周后再次出现，向第七班复仇，佐助的对手是拥有冰遁血继限界的白。
由于受过训练的缘故，佐助很快跟上了白的速度。
白为了摆脱劣势，使出秘术魔镜冰晶，将佐助困在里面。此时，匆忙赶到的鸣人冲动地踏进了白的陷阱。
佐助在和白的战斗中，不断尝试，最终成功唤醒了自身的血继限界写轮眼。
这时的佐助不但可以看穿白在镜中光速般的移动，甚至还可以掩护重伤的鸣人。
白感觉到了不妙，利用攻击鸣人来造成佐助的破绽。佐助明知是计，仍然用自己的身体掩护了鸣人。
为了掩饰对鸣人的保护，他傲娇的说这样做不是为了救他，只是身体不由自主罢了。
最终，愤怒的鸣人用九尾的力量击败了白，而佐助其实只是晕了过去，不久就恢复了知觉。
中忍考试-中忍考试前，李洛克前来挑战佐助。佐助认为自己的写轮眼可以复制任何招数，并没把李放在眼里。
然而李在速度和身手上有着一定优势，虽然两人没战斗到最后，但让李胜利的事实还是让佐助非常不爽。
在第一场笔试中，佐助发现自己一题也不会，但他很快意识到考试的重点在于考验如何在不被发现的情况下抄袭，而是考忍者的观察能力（找到有答案的人）以及在无人发现的情况下快速的获取情报信息的能力（抄袭答案），而不是靠自己答题。
佐助利用自己的写轮眼，通过复制其他考生的铅笔移动完成考题。
在考试不久就遭到大蛇丸攻击，在大蛇丸的强大实力之下，佐助非常害怕。
就在佐助为保住性命，要将卷轴交给大蛇丸的时候，鸣人出现并勇敢地和大蛇丸战斗。鸣人的激将法激发了佐助的斗志，佐助使出“写轮眼操风车?三之大刀”将大蛇丸压制，并用火遁豪火球术烧毁了大蛇丸的脸。
出于对佐助天赋的欣赏，大蛇丸给佐助种下天之咒印。
佐助痛苦地倒下，而大蛇丸离开前告诉樱，佐助迟早会来找他获取力量。因为中咒印的缘故，佐助和鸣人一样失去知觉，樱在一旁照料。
正在这时，一群音忍奉大蛇丸之命来干掉佐助，战况十分不利。
苏醒的佐助浑身布满咒印黑色的花纹，愤怒地向攻击樱的萨克攻击。
由于咒印的力量，佐助稳占上风，他愤怒地扭断了萨克的手臂，并准备向其他两名音忍攻击。
樱察觉到咒印状态的佐助失去了控制，抱住佐助，求他停手。樱的举动让佐助恢复了正常，在一旁惊恐万状的音忍们留下卷轴，赶紧逃离了现场。
为阻止佐助经受不起力量的诱惑而使用咒印，卡卡西在接下来的一个月时间里单独陪佐助训练。
佐助在和卡卡西的训练期间，学会了卡卡西的成名绝技千鸟，同时还针对我爱罗练习了从李那里复制的高速体术。
虽然在正式比赛的时候迟到，但佐助的高速移动让我爱罗陷入苦战，不得不用沙子将自己全身包围起来。佐助趁此机会首次使用千鸟，结果成功破解对手的绝对防御，并打伤了对手。与此同时，砂忍和音忍的木叶毁灭计划开始实施。
我爱罗在砂忍的掩护下从木叶撤退。佐助追击我爱罗，一路上过关斩将，最终追上了对方。
佐助一再使出千鸟，并打断我爱罗用沙所凝成的一只手臂。被激怒的我爱罗使用守鹤的力量来反击，而佐助则由于咒印发作无法动弹，体力不支而倒下。
就在千钧一发之际鸣人及时赶到，经过一番苦战后成功击败了我爱罗。
在得知卡卡西被突然出现在木叶的鼬击败后，佐助去看卡卡西，从看望卡卡西的人那里得知鼬回到木叶的目的是要寻找鸣人，他立刻前往鸣人那里。
在与鼬正式碰面后，佐助立刻使出千鸟对付鼬，却被鼬轻易破解并折断手腕。虽然佐助不依不饶，但鼬似乎并不想搭理他。鼬使用月读毫不留情地击溃佐助并再三强调他的力量太弱。
佐助精神涣散昏迷，被自来也及时救走，后被迈特凯背回木叶的医院养伤。
在路上，佐助再次碰到音忍四人众。
音忍给佐助提升咒印状态的药丸，吃下药丸进入假死状态的佐助被封印到特制的棺桶中，四人组带着棺桶前往大蛇丸的实验基地。