尽管山内上杉家从村上家、诹访家、武田家手中夺取了一部分海野家的旧领，但海野家家督海野栋纲仍被上杉宪政留在了上野一国。
只有矢泽赖纲（矢泽纲赖，真田幸隆之弟）、祢津元直（滋野三家之一，后其女为武田晴信侧室）等极少数人得以返回旧领，就连真田幸隆（真田幸纲）、常田隆永、镰原幸定兄弟几人都只能寄食在山内上杉家重臣长野业正处。
虽然诹访赖重成功与山内上杉家达成停战议和，并获得了长洼、芦田两乡，但此时的诹访家已是强弩之末。
因为，诹访家连年的连年出兵导致诹访家的实力迅速衰退。
早在天文六年开始，诹访赖重就与时任信浓守护小笠原长时交恶，诹访家也因此与小笠原家进行了长达两年之久的战事，但两家谁都奈何不了谁。
到了天文八年末，诹访赖重又与武田信虎联合起来出兵佐久郡、小县郡，与大井家、海野家先后交锋。
到了天文九年，因强力台风过境，以及来自甲斐一国的饥荒、瘟疫、蝗灾等灾害蔓延，导致诹访家领内疲敝，人人皆有叛心。加上连年的战事，使得诹访家军马疲惫，士卒凋零，实力大为减弱。
更为雪上加霜的是，诹访家同族、旗下国人领主都对诹访赖重的穷兵黩武感到非常不满，尤其是诹访大社上社权祝（辅佐诹访大社大祝的神官）矢岛满清、诹访赖重之叔诹访满邻和诹访满隆、诹访西方众（诹访湖西部国人众）等先后与诹访赖重发生了严重的对立。
甚至就连出自诹访一族的高远城城主高远赖继还打算趁机除掉诹访赖重，好取得诹访大社大祝之位，并成为诹访氏的一门总领。
武田晴信见诹访家实力的不断衰退，以及同族、旗下国人领主蠢蠢欲动，就认为夺取诹访郡的时机已至。
自从长尾晴景重返春日山城后，就不再重视轩辕众，对轩辕众的资金投入也是越来越少，使得头领道闲以下的轩辕众忍者都感到非常不满，甚至还有一部分忍者出走奥信浓的户隐山，为户隐众效力。
就在山内上杉家将势力成功延伸至信浓的小县郡、佐久郡之际，身兼两越佐（越中、越后、佐渡）三国守护的上杉清定并没有对村上家落井下石，反而通过小岛入道、船见宫内少辅、本田新助、林平右卫门尉等原府中长尾家马廻众、谱代家臣劝诱府中长尾家的御用忍者众轩辕众为越后上杉家效力。
土屋昌远之父土屋信远是武田信昌的女婿，因此土屋昌远算是武田信虎的从兄弟。在武田信虎继任武田家家督之位后一直追随武田信虎四处作战。在武田信虎被流放骏河国以后，土屋昌远不仅没有返回甲斐国，而是选择继续侍奉武田信虎。等到武田信虎上洛出仕足利将军家时，土屋昌远也随其同行。
在清定看来，获取邻近诸国情报也是不可或缺的。只有对邻近诸国的大名动向了如指掌，自己才能及时做出对越后上杉家有利的判断，毕竟知己知彼，百战不殆。天朝早在春秋末期的兵书《孙子?计》中就提出了“能而示之不能，用而示之不用，近而示之远，远而示之近”，以及用谋、示形、用间的情报斗争思想。
至于收集关东八国方面的情报，清定则是交给了上野出身的湛光风车。
原本，武田晴信就对诹访赖重擅自与山内上杉家达成停战议和一事感到非常不满。因为山内上杉家让予诹访家的领地中还有一部分是武田信虎时期夺取的。虽说眼下的武田家才发生家督更替之事不久，但武田信虎被自己流放至骏河后，甲斐一国的百姓们可谓是弹冠相庆、奔走相告。
清定对轩辕众上下的识时务感到非常高兴，他当即任命道闲为越后上杉家的物见奉行，负责招募和训练忍者，以及对北陆道诸国、甲信两国进行收集情报。
在甲斐境内出现饥荒、水灾、蝗灾、台风等诸多自然灾害后，四处都能看到饿死的人和马匹，甚至有些地区以及达到了一千人中只有一个人在幸存的惨状。而作为时任武田家家督、甲斐守护的武田信虎非但不开仓放粮救灾，甚至还不断地催促甲斐一国的国人领主们出兵信浓佐久郡、小县郡等地，导致国人领主们、百姓都对此怨声载道。
因此，与其说流放武田信虎的武田家重臣们是“武田晴信派”，倒不如说这些家臣们其实是被迫倒向武田晴信一方的“反武田信虎派”。若是武田晴信也继续着父亲武田信虎的路线，迟早也会落得一样的下场，还有可能更惨。
在武田信虎被流放到骏河以后，随行的家臣仅有土屋昌远一人继续追随左右。
轩辕众头领道闲在与加藤段藏、玄鬼、觉马、峰坊、谷坊等村中的上忍进行商议后，就决定改换门庭，今后将效力于越后上杉家旗下。
要知道，当时的人们都认为天灾是因为领主的“不德”而导致上天降下的天罚，连武田信昌这样的中兴之主在地震之后都晓得要老老实实的让出家督之位退居二线。而武田信虎在天灾之后非但没有引咎退位，甚至还没有做出任何回应，家臣、百姓们对武田信虎的不满已经到达了临界点。
其实，最令人感到意外的是，武田信虎在被流放之时为四十六岁，还能算是壮年。但武田信虎却并没有选择借助女婿今川义元、诹访赖重的力量去与武田晴信对抗，反而是老老实实地待在骏河一国——武田晴信非常有‘孝心’的除了武田信虎正室大井之方以外的女中众（侧室、侍女等）送至骏河，还为武田信虎准备了一笔‘隐居料’。
也正是由于武田信虎被流放这回事，让武田晴信深刻体会到了什么叫“君者，舟也，庶人者，水也，水能载舟，亦能覆舟（《荀子·王制篇》）”，他在继承家督之位后就开始重视领地内的民生。
可武田信虎并没有对此感到重视，但是武田晴信却察觉到了。
正所谓良禽择木而栖，贤臣择主而仕。